1. Główna
  2. Podatki, Rachunkowość, Kadry, ZUS, BHP, AML, Finanse i Ubezpieczenia, Dotacje, Sygnaliści
  3. Ordynacja podatkowa
  4. Zakres stosowania przepisów postępowania podatkowego do czynności sprawdzających i kontroli podatkowej
Data publikacji: 12.05.2026

Zakres stosowania przepisów postępowania podatkowego do czynności sprawdzających i kontroli podatkowej

W praktyce podatkowej często pojawia się pytanie, w jakim zakresie przepisy regulujące postępowanie podatkowe mają zastosowanie do czynności sprawdzających i kontroli podatkowej. Choć czynności te nie są klasycznym postępowaniem podatkowym, wiele zasad i procedur wynikających z Ordynacji podatkowej stosuje się do nich odpowiednio. Dla przedsiębiorcy oznacza to zarówno określone prawa, jak i obowiązki – a także gwarancje ochrony przed arbitralnym działaniem organów podatkowych.


🔍 Czym są czynności sprawdzające i kontrola podatkowa?

Zarówno czynności sprawdzające, jak i kontrola podatkowa to działania organów podatkowych służące weryfikacji rzetelności rozliczeń podatkowych.

  • Czynności sprawdzające mają na celu szybkie sprawdzenie prawidłowości deklaracji lub wniosków (np. o zwrot VAT).
  • Kontrola podatkowa natomiast jest bardziej sformalizowana i dotyczy sprawdzenia prawidłowości wywiązywania się z obowiązków podatkowych w szerszym zakresie.

Mimo że regulacje dotyczące kontroli podatkowej (dział VI Ordynacji podatkowej) nie są kompletne, ustawodawca przewidział, że w wielu kwestiach należy sięgać do przepisów działu IV o postępowaniu podatkowym – zgodnie z art. 292 Ordynacji podatkowej.


⚖️ Zasady postępowania podatkowego w kontroli – gwarancja bezstronności

Zgodnie z art. 292 o.p., w toku kontroli podatkowej stosuje się odpowiednio przepisy działu IV Ordynacji podatkowej, a także art. 102 o.p..
Oznacza to, że do kontroli podatkowej przenosi się m.in. zasady ogólne postępowania podatkowego, takie jak:

  • zasada prawdy obiektywnej,
  • zasada czynnego udziału strony w postępowaniu,
  • zasada przekonywania,
  • czy zasada zaufania do organów podatkowych.

👉 Dla przedsiębiorcy oznacza to, że organ podatkowy ma obowiązek działać rzetelnie i bezstronnie, a przebieg kontroli musi odpowiadać standardom uczciwego postępowania administracyjnego.

Dodatkowo, poprzez odpowiednie zastosowanie przepisów o wyłączeniu pracownika lub organu podatkowego (np. w sytuacji konfliktu interesów), ustawodawca chroni podatnika przed stronniczym działaniem organu. To kluczowa gwarancja budowania zaufania do administracji skarbowej.


👥 Kogo może objąć kontrola podatkowa?

W przeciwieństwie do klasycznego postępowania podatkowego, kontrola podatkowa obejmuje węższy krąg podmiotów. Nie każdy, kto mógłby być stroną w postępowaniu podatkowym, może zostać objęty kontrolą.
Kontrola może dotyczyć wyłącznie:

  • podatnika,
  • płatnika,
  • inkasenta,
  • lub ich następców prawnych.

Nie można więc prowadzić kontroli wobec osób trzecich, które np. odpowiadają za cudze zaległości podatkowe (jak członkowie zarządu spółki).


⚰️ Śmierć podatnika a trwająca kontrola

Jeśli w trakcie kontroli podatkowej zmarł podatnik będący osobą fizyczną, to – zgodnie z art. 102 o.p. – jego spadkobiercy wstępują w jego prawa i obowiązki. Kontrola może więc być kontynuowana wobec nich.

Z kolei art. 135 o.p. wskazuje, że zdolność prawną i do czynności prawnych w sprawach podatkowych ocenia się na podstawie przepisów prawa cywilnego (chyba że prawo podatkowe stanowi inaczej).

To istotne, ponieważ w prawie podatkowym istnieją też szczególne podmioty – jak np. podatkowe grupy kapitałowe, które mimo braku klasycznej osobowości prawnej są traktowane jako podatnicy i mogą być objęte kontrolą.


🧑‍⚖️ Kurator w postępowaniu kontrolnym

Jeżeli kontrolowany podatnik jest osobą:

  • niezdolną do czynności prawnych,
  • nieobecną,
  • albo gdy osoba prawna nie ma organu uprawnionego do reprezentacji,

organ podatkowy może wystąpić do sądu o ustanowienie kuratora.
Taką możliwość przewiduje art. 135 o.p., stosowany odpowiednio do kontroli podatkowej.
Kurator działa wtedy w imieniu podatnika, co pozwala na prowadzenie kontroli mimo przeszkód formalnych.


✉️ Doręczenia, wezwania, protokoły i dostęp do akt

Kontrola podatkowa wymaga sprawnej komunikacji między przedsiębiorcą a organem. Zgodnie z art. 292 o.p., do czynności kontrolnych stosuje się odpowiednio przepisy Ordynacji podatkowej dotyczące:

  • doręczeń i wezwań,
  • sporządzania protokołów i adnotacji,
  • oraz udostępniania akt sprawy.

Dzięki temu kontrolowany przedsiębiorca ma gwarancję, że wszystkie pisma i decyzje zostaną mu doręczone w sposób prawidłowy, a także że ma prawo wglądu w dokumenty dotyczące prowadzonej kontroli.


💼 Kary porządkowe i koszty postępowania

Do kontroli podatkowej stosuje się również odpowiednio przepisy działu IV Ordynacji podatkowej dotyczące:

  • kar porządkowych (np. za niestawienie się na wezwanie, odmowę złożenia wyjaśnień),
  • oraz kosztów postępowania.

Celem tych przepisów jest zapewnienie sprawnego przebiegu kontroli i dyscyplinowanie uczestników postępowania.

📌 Dla przedsiębiorcy oznacza to, że może zostać ukarany karą porządkową, jeśli np. utrudnia czynności kontrolne – ale jednocześnie ma prawo do odwołania się od takiej kary, jeśli została nałożona bezpodstawnie.

⏳ Terminy zakończenia kontroli podatkowej

Zgodnie z art. 292 Ordynacji podatkowej do kontroli stosuje się odpowiednio także przepisy działu IV tej ustawy, które dotyczą terminów załatwiania spraw.
Jednak podstawowy przepis w tym zakresie znajduje się bezpośrednio w dziale VI, czyli w regulacjach dotyczących kontroli podatkowej – to art. 284b o.p.

📅 Zasada szybkości postępowania kontrolnego

Z przepisu tego wynika, że kontrola podatkowa powinna być zakończona bez zbędnej zwłoki, a w każdym przypadku w terminie wskazanym w upoważnieniu do jej przeprowadzenia.
Jeśli kontrolujący nie może zakończyć jej w terminie, ma obowiązek:

  • zawiadomić kontrolowanego na piśmie,
  • podać przyczynę przedłużenia kontroli,
  • oraz wskazać nowy termin jej zakończenia.

To bardzo ważna gwarancja dla przedsiębiorcy, ponieważ chroni go przed przewlekłym prowadzeniem czynności przez urząd skarbowy.


⏱ Ograniczenia czasu kontroli przedsiębiorcy

Czas prowadzenia kontroli podatkowej u przedsiębiorcy jest ściśle limitowany.
Zgodnie z art. 55 ustawy Prawo przedsiębiorców, kontrola nie może trwać:

  • dłużej niż 12 dni roboczych w przypadku mikroprzedsiębiorcy,
  • 18 dni roboczych w przypadku małego przedsiębiorcy,
  • 24 dni robocze w przypadku średniego przedsiębiorcy,
  • oraz 48 dni roboczych w przypadku pozostałych.

📄 Jednak ustawa przewiduje wyjątki od tych limitów. Ograniczenia czasu kontroli nie mają zastosowania, jeśli:

  • kontrola jest niezbędna dla przeciwdziałania popełnieniu przestępstwa skarbowego lub wykroczenia skarbowego,
  • albo ma na celu zabezpieczenie dowodów jego popełnienia,
  • a także gdy kontrola dotyczy zasadności zwrotu podatku VAT przed dokonaniem tego zwrotu.

W praktyce oznacza to, że w przypadku podejrzenia poważnych nieprawidłowości urząd może prowadzić kontrolę dłużej, ale musi to być uzasadnione i udokumentowane.


⌛ Niewliczanie okresów zawieszenia i opóźnień

Zastosowanie ma tu również art. 139 Ordynacji podatkowej, zgodnie z którym do terminu zakończenia kontroli nie wlicza się:

  • okresów przewidzianych w przepisach prawa podatkowego dla dokonania określonych czynności,
  • okresów zawieszenia postępowania,
  • oraz opóźnień spowodowanych z winy strony lub z przyczyn niezależnych od organu.

Ważne jest to, że nawet jeśli niedotrzymanie terminu nastąpiło z przyczyn niezależnych od kontrolujących, to – na mocy art. 140 § 2 o.p. – organ nadal ma obowiązek poinformować podatnika o przyczynach opóźnienia i nowym terminie zakończenia kontroli.

Ta transparentność w komunikacji ma chronić przedsiębiorców przed sytuacjami, gdy kontrola przeciąga się bez uzasadnienia.


💤 Zawieszenie kontroli podatkowej

Przepisy Ordynacji podatkowej przewidują możliwość zawieszenia kontroli w szczególnych przypadkach.
Zgodnie z:

  • art. 284 § 4 o.p., kontrola może zostać zawieszona, jeśli nie można jej wszcząć z powodu nieobecności kontrolowanego lub jego przedstawiciela,
  • natomiast art. 284a § 5 o.p. pozwala na zawieszenie kontroli w przypadku niemożności zidentyfikowania kontrolowanego.

W takich przypadkach stosuje się odpowiednio przepisy rozdziału 4 działu IV o.p., które dotyczą zawieszenia postępowania podatkowego.

Zawieszenie kontroli oznacza, że w tym czasie nie biegną żadne terminy, a organ może wznowić postępowanie dopiero po ustaniu przeszkody (np. po powrocie przedsiębiorcy z dłuższego wyjazdu służbowego).


📄 Skutki przekroczenia terminu kontroli

art. 284b § 3 o.p. wynika bardzo istotna zasada:
👉 dokumenty sporządzone po upływie terminu zakończenia kontroli nie mogą być dowodem w postępowaniu podatkowym,
chyba że organ wyznaczył nowy termin zakończenia kontroli i poinformował o tym podatnika.

W praktyce oznacza to, że jeśli urząd skarbowy zapomniał lub zaniechał formalnego przedłużenia kontroli, wszystkie późniejsze czynności kontrolne mogą zostać uznane za bezskuteczne.

Podobne rozwiązanie zawiera art. 46 ust. 3 Prawa przedsiębiorców, który wskazuje, że czynności dokonane po upływie dopuszczalnego czasu kontroli nie wywołują skutków prawnych wobec przedsiębiorcy.


📨 Ponaglenie na niezałatwienie sprawy w terminie

Zgodnie z odpowiednio stosowanym art. 141 o.p., kontrolowany ma prawo wniesienia ponaglenia na niezałatwienie sprawy w terminie.
Ponaglenie składa się do organu wyższego stopnia, a jego celem jest przyspieszenie postępowania i wyeliminowanie przewlekłości.

W praktyce, jeśli urząd nie zakończy kontroli w terminie, a podatnik nie został prawidłowo poinformowany o przedłużeniu, może on formalnie domagać się interwencji przełożonych organu prowadzącego kontrolę.


⚠️ Odpowiedzialność urzędników za przekroczenie terminu kontroli

Art. 142 o.p., stosowany odpowiednio do kontroli podatkowej, przewiduje, że kontrolujący, który bez uzasadnionych przyczyn nie zakończył kontroli w terminie lub nie dopełnił obowiązku poinformowania o przedłużeniu terminu, ponosi odpowiedzialność porządkową, dyscyplinarną lub inną przewidzianą prawem.

W skrajnych przypadkach, jeśli działanie urzędnika skutkowało rażącym naruszeniem prawa, zastosowanie może mieć również:

ustawa z dnia 20 stycznia 2011 r. o odpowiedzialności majątkowej funkcjonariuszy publicznych za rażące naruszenie prawa.

To bardzo istotna regulacja z punktu widzenia przedsiębiorcy – stanowi realny środek ochrony przed nadużyciami i przewlekłością działań organów podatkowych.


💡 Przykład praktyczny

Spółka „EkoTrans Sp. z o.o.” z Łodzi została objęta kontrolą podatkową w zakresie rozliczeń VAT za rok 2023. W upoważnieniu do kontroli wyznaczono termin jej zakończenia na 30 czerwca 2025 r.

Kontrola trwała długo z powodu braków w dokumentacji. Urząd nie poinformował jednak spółki o przedłużeniu terminu. Mimo to kontrolujący dokonali czynności 15 lipca, sporządzając protokół.

W takiej sytuacji, zgodnie z art. 284b § 3 o.p.czynności te nie mogą stanowić dowodu w dalszym postępowaniu podatkowym, ponieważ zostały dokonane po upływie terminu bez jego formalnego przedłużenia.

Spółka mogła również złożyć ponaglenie do organu wyższego stopnia i żądać wyciągnięcia konsekwencji wobec urzędnika prowadzącego kontrolę.

Podstawa prawna

W poradniku omówiono i zastosowano przepisy następujących aktów prawnych:

  • art. 292 – ustawa z dnia 29 sierpnia 1997 r. – Ordynacja podatkowa (Dz.U. z 2024 r. poz. 164 ze zm.)
  • art. 102 – ustawa z dnia 29 sierpnia 1997 r. – Ordynacja podatkowa
  • art. 135 – ustawa z dnia 29 sierpnia 1997 r. – Ordynacja podatkowa
  • art. 139–142 – ustawa z dnia 29 sierpnia 1997 r. – Ordynacja podatkowa
  • art. 284, art. 284a, art. 284b – ustawa z dnia 29 sierpnia 1997 r. – Ordynacja podatkowa
  • art. 55, art. 46 – ustawa z dnia 6 marca 2018 r. – Prawo przedsiębiorców (Dz.U. z 2024 r. poz. 2366 ze zm.)
  • ustawa z dnia 20 stycznia 2011 r. o odpowiedzialności majątkowej funkcjonariuszy publicznych za rażące naruszenie prawa (Dz.U. z 2023 r. poz. 1538)

🧾 Tematy zawarte w poradniku

  • zakres stosowania przepisów postępowania podatkowego do kontroli podatkowej
  • terminy i zasady prowadzenia kontroli podatkowej przedsiębiorcy
  • prawa i obowiązki podatnika w trakcie kontroli skarbowej
  • ponaglenie i odpowiedzialność urzędników za przewlekłość kontroli
  • zastosowanie art. 292 Ordynacji podatkowej w praktyce

🔗 Linki do źródeł

art. 2 data act ceny transferowe data act egzekucja z nieruchomości kalkulator komentarz kontrola podatkowa kredyt konsumencki KRZ masa upadłości masa upadłościowa postępowanie egzekucyjne postępowanie o zatwierdzenie układu postępowanie podatkowe prawo autorskie pre-pack przekształcenia spółek PZP restrukturyzacja RODO sztuczna inteligencja TSUE umowa ubezpieczenia upadłość WNiP wzór właściwość miejscowa właściwość sądu zobowiązania środki trwałe

Czy ten artykuł był pomocny?

Powiązane artykuły