Data publikacji: 08.01.2026

Organy podatkowe w Polsce – struktura, kompetencje i podział na instancje

System podatkowy w Polsce opiera się na rozbudowanej strukturze organów podatkowych, które pełnią kluczową rolę w wymiarze, poborze i kontroli należności publicznoprawnych. W praktyce to właśnie od właściwego działania tych organów zależy sprawność rozliczeń przedsiębiorców z fiskusem, a także prawidłowość decyzji podatkowych.

Poniższy poradnik wyjaśnia, czym są organy podatkowe, jakie mają kompetencje, jak są podzielone na instancje i jakie znaczenie ma ich klasyfikacja dla podatników.


Czym jest organ podatkowy?

Choć ustawodawca nie wprowadził legalnej definicji organu podatkowego, to art. 13 Ordynacji podatkowej (dalej: o.p.) wymienia, jakie organy pełnią funkcje podatkowe – zarówno w pierwszej, jak i drugiej instancji postępowania podatkowego.

W doktrynie przyjmuje się, że organem podatkowym jest osoba lub grupa osób działająca w strukturze organizacyjnej państwa albo jednostki samorządu terytorialnego, powołana do realizacji przepisów prawa podatkowego w granicach swoich kompetencji. Oznacza to, że organ taki ma prawo wydawać wiążące rozstrzygnięcia wobec podatników – na przykład decyzje o wysokości podatku, odroczeniu terminu płatności czy stwierdzeniu nadpłaty.

📄 Warto wiedzieć: Organ podatkowy nie jest tożsamy z urzędem, w którym działa. Urząd to zaplecze organizacyjne (pracownicy, sprzęt, infrastruktura), dzięki któremu organ może realizować swoje zadania.


Organ, piastun i urząd – trzy różne pojęcia

W praktyce często myli się trzy pojęcia: organpiastun organu i urząd.
Różnice te mają znaczenie nie tylko teoretyczne, lecz także praktyczne, np. przy doręczaniu decyzji lub ustalaniu odpowiedzialności za błędy administracyjne.

  • Organ podatkowy – to instytucja wyposażona w kompetencje wynikające z przepisów prawa (np. naczelnik urzędu skarbowego).
  • Piastun organu – to osoba fizyczna, która faktycznie wykonuje kompetencje organu (np. konkretny naczelnik urzędu powołany na stanowisko).
  • Urząd – to instytucja organizacyjna (np. urząd skarbowy), która zapewnia organowi środki techniczne, kadrowe i finansowe do realizacji zadań.

📌 Przykład:
Pan Andrzej Kowalik został powołany na stanowisko naczelnika Urzędu Skarbowego w Piotrkowie Trybunalskim. W tym przypadku:

  • organem podatkowym jest naczelnik urzędu skarbowego,
  • piastunem organu – Andrzej Kowalik,
  • urzędem – Urząd Skarbowy w Piotrkowie Trybunalskim.

Organy podatkowe administracji rządowej

Organy podatkowe administracji rządowej działają w imieniu Skarbu Państwa. Ich zadaniem jest m.in. wymiar i pobór podatków stanowiących dochody budżetu państwa, kontrola prawidłowości rozliczeń, egzekucja należności oraz wydawanie interpretacji przepisów podatkowych.

Zgodnie z art. 13 Ordynacji podatkowej, do organów podatkowych administracji rządowej należą:

  • minister właściwy do spraw finansów publicznych,
  • Szef Krajowej Administracji Skarbowej (KAS),
  • dyrektor Krajowej Informacji Skarbowej (KIS),
  • dyrektorzy izb administracji skarbowej,
  • naczelnicy urzędów skarbowych,
  • naczelnicy urzędów celno-skarbowych.

Struktura i zadania Krajowej Administracji Skarbowej (KAS)

Zasady organizacji i funkcjonowania rządowej administracji podatkowej określa ustawa o Krajowej Administracji Skarbowej (u.KAS).
Zgodnie z art. 2 u.KAS, do zadań KAS należy m.in.:

  • realizacja dochodów budżetu państwa z podatków, opłat i innych należności,
  • pobór należności celnych w ramach polityki celnej Unii Europejskiej,
  • egzekucja administracyjna należności publicznoprawnych,
  • przeciwdziałanie praniu pieniędzy i finansowaniu terroryzmu,
  • kontrola dewizowa,
  • zwalczanie przestępstw i wykroczeń skarbowych.

W praktyce KAS łączy funkcje fiskalne, kontrolne, dochodzeniowe i informacyjne, co pozwala na kompleksowe zarządzanie procesem poboru podatków i kontroli ich prawidłowości.


Jednostki organizacyjne KAS

Zgodnie z art. 36 ust. 1 u.KAS, w skład Krajowej Administracji Skarbowej wchodzą m.in.:

  • urząd obsługujący ministra finansów,
  • Krajowa Informacja Skarbowa,
  • izby administracji skarbowej,
  • urzędy skarbowe i urzędy celno-skarbowe,
  • Krajowa Szkoła Skarbowości.

W sprawach organizacyjnych izba administracji skarbowej wraz z podległymi jej urzędami skarbowymi i urzędami celno-skarbowymi stanowi jednostkę organizacyjną, którą kieruje dyrektor izby. Wszystkie te jednostki podlegają Szefowi Krajowej Administracji Skarbowej.

⚠️ Ważne: Działalność KAS jest finansowana z budżetu państwa, jednak dysponentem środków nie jest Szef KAS, lecz minister finansów.


Hierarchia i kompetencje organów KAS

KAS posiada hierarchiczną strukturę, w której wyróżnić można organy centralne i terenowe:

Organy centralne:

  • Minister Finansów – wydaje interpretacje ogólne, objaśnienia podatkowe, porozumienia inwestycyjne,
  • Szef KAS – nadzoruje całość administracji skarbowej, wydaje decyzje w sprawach klauzuli przeciwko unikaniu opodatkowania, porozumień cenowych i opinii zabezpieczających,
  • Dyrektor Krajowej Informacji Skarbowej (KIS) – odpowiada za interpretacje indywidualne i wiążące informacje stawkowe (WIS) oraz akcyzowe (WIA).

Organy terenowe:

  • Dyrektorzy izb administracji skarbowej (DIAS) – nadzorują urzędy skarbowe i urzędy celno-skarbowe, pełnią funkcję organów drugiej instancji,
  • Naczelnicy urzędów skarbowych – prowadzą większość postępowań podatkowych jako organy pierwszej instancji,
  • Naczelnicy urzędów celno-skarbowych – prowadzą kontrole celno-skarbowe oraz postępowania wynikające z ich przekształcenia.

📌 Przykład praktyczny:
Spółka Novatech Sp. z o.o. z Gdańska otrzymała decyzję o zaległości w VAT wydaną przez naczelnika urzędu skarbowego. Od tej decyzji może wnieść odwołanie do dyrektora izby administracji skarbowej, który pełni funkcję organu drugiej instancji.


Radcy skarbowi – kto może wydawać decyzje?

W niektórych przypadkach decyzje podatkowe w imieniu organu wydają radcy skarbowi, działający w urzędach skarbowych, celno-skarbowych i izbach administracji skarbowej.
Ich kompetencje obejmują wyłącznie fazę orzeczniczą postępowania – mogą więc podpisać decyzję merytoryczną lub formalną, ale nie wszczynają postępowania ani nie prowadzą czynności dowodowych.

Samorządowe organy podatkowe

Poza organami administracji rządowej, istotną rolę w systemie podatkowym pełnią również organy jednostek samorządu terytorialnego, czyli gmin, powiatów i województw.
Ich zadaniem jest wymiar i pobór danin, które stanowią dochody własne samorządów – np. podatku od nieruchomości, podatku rolnego, leśnego, od środków transportowych czy opłat lokalnych.

Ustawodawca nie powołał odrębnych, wyspecjalizowanych organów samorządowych do spraw podatków. Zgodnie z art. 13 § 1 pkt 3 Ordynacji podatkowejorganami podatkowymi samorządu są organy wykonawcze jednostek samorządowych:

  • w gminie – wójt, burmistrz lub prezydent miasta,
  • w powiecie – starosta,
  • w województwie – marszałek województwa.

Każdy z tych organów działa w imieniu swojej jednostki i reprezentuje ją jako wierzyciela podatkowego, tzn. podmiot, na rzecz którego pobierany jest podatek.

📌 Przykład:
Firma „Agro-Mix” złożyła wniosek o umorzenie zaległości w podatku rolnym. Właściwym organem do rozpatrzenia tego wniosku jest wójt gminy, ponieważ to on jest organem podatkowym gminy – nie urząd gminy, ani rada gminy.


Samorządowe kolegia odwoławcze (SKO)

Szczególne miejsce w systemie organów podatkowych zajmują samorządowe kolegia odwoławcze (SKO).
Choć w Ordynacji podatkowej zaliczane są do organów odwoławczych od decyzji samorządowych organów podatkowych, to w sensie ustrojowym stanowią jednostki organizacyjne Skarbu Państwa, a nie organ samorządu terytorialnego.

Oznacza to, że:

  • są one państwowymi jednostkami budżetowymi,
  • nie podlegają żadnej jednostce samorządu terytorialnego,
  • nadzór nad ich działalnością administracyjną sprawuje Prezes Rady Ministrów,
  • członków kolegiów powołuje właśnie Prezes Rady Ministrów.

Przy orzekaniu członkowie SKO są związani wyłącznie przepisami prawa, a nie poleceniami organów nadrzędnych.
W sprawach podatkowych SKO rozpatrują odwołania od decyzji wydanych przez wójta, burmistrza, prezydenta miasta, starostę czy marszałka województwa.

📄 Podstawa prawna: art. 13 § 1 pkt 3 Ordynacji podatkowej.

📚 Przykład:
Przedsiębiorca z Poznania otrzymał decyzję prezydenta miasta o wymiarze podatku od nieruchomości. Po złożeniu odwołania sprawa trafia do Samorządowego Kolegium Odwoławczego w Poznaniu, które może decyzję utrzymać w mocy, uchylić lub umorzyć postępowanie.


Klasyfikacja organów podatkowych

Organy podatkowe można podzielić według kilku kryteriów:

  • podmiotowego (kto jest wierzycielem podatkowym),
  • terytorialnego (zasięg działania),
  • funkcjonalnego (instancja postępowania),
  • składu osobowego (monokratyczne lub kolegialne).

Poniżej omówiono te kryteria szczegółowo.


1️⃣ Podział według rodzaju podmiotu (wierzyciela podatkowego)

  • Organy administracji rządowej – działają w imieniu Skarbu Państwa (np. Szef KAS, minister finansów, dyrektor KIS, naczelnicy urzędów skarbowych).
  • Organy samorządowe – działają w imieniu jednostek samorządu terytorialnego (np. wójt, burmistrz, starosta, marszałek).

2️⃣ Podział według zasięgu terytorialnego

  • Organy centralne (działające na obszarze całego kraju):
    • minister finansów,
    • Szef KAS,
    • dyrektor Krajowej Informacji Skarbowej.
  • Organy terenowe (działające na określonym obszarze):
    • dyrektorzy izb administracji skarbowej,
    • naczelnicy urzędów skarbowych,
    • naczelnicy urzędów celno-skarbowych,
    • wójtowie, burmistrzowie, prezydenci miast, starostowie i marszałkowie województw,
    • samorządowe kolegia odwoławcze.

Ciekawym wyjątkiem są naczelnicy urzędów celno-skarbowych – ich terytorialna właściwość w zakresie kontroli celno-skarbowej obejmuje cały kraj, mimo że formalnie działają jako organy terenowe.


3️⃣ Podział według funkcji (instancji)

W systemie podatkowym funkcjonują dwie instancje postępowania:

Organy pierwszej instancji:

  • naczelnicy urzędów skarbowych,
  • naczelnicy urzędów celno-skarbowych,
  • dyrektorzy izb administracji skarbowej (w niektórych sprawach określonych odrębnymi przepisami),
  • dyrektor KIS (np. przy interpretacjach indywidualnych),
  • Szef KAS (w wybranych postępowaniach, np. w sprawach klauzuli GAAR),
  • minister finansów (np. przy ogólnych interpretacjach),
  • wójtowie, burmistrzowie, prezydenci miast, starostowie, marszałkowie województw.

Organy drugiej instancji (odwoławcze):

  • dyrektorzy izb administracji skarbowej (od decyzji naczelników urzędów skarbowych i celno-skarbowych),
  • Szef KAS,
  • dyrektor KIS (np. przy odwołaniu od WIS i WIA),
  • minister finansów,
  • samorządowe kolegia odwoławcze.

📄 Podstawa prawna: art. 13 Ordynacji podatkowej.


4️⃣ Podział według liczby osób w organie

Z punktu widzenia składu osobowego wyróżniamy:

  • Organy monokratyczne – decyzje podejmuje jedna osoba (np. naczelnik urzędu skarbowego, wójt, burmistrz, prezydent miasta, Szef KAS).
  • Organy kolegialne – decyzje zapadają w składach kilkuosobowych (np. samorządowe kolegia odwoławcze, które orzekają zasadniczo w składzie trzech członków).

📌 Przykład:
W sprawie odwołania przedsiębiorcy od decyzji o podatku od środków transportowych, SKO w Lublinie orzekało w składzie trzyosobowym – tylko wspólnie podjęta decyzja wywołuje skutki prawne.


Organy wyższego stopnia

Istotnym pojęciem dla przedsiębiorców korzystających z prawa do odwołania jest organ wyższego stopnia.
Zgodnie z art. 13 § 3 Ordynacji podatkowej, organami wyższego stopnia są organy odwoławcze, czyli te, które rozpoznają odwołania od decyzji organów pierwszej instancji.

Ich zadaniem jest:

  • kontrola instancyjna (czy decyzja była prawidłowa),
  • rozpoznawanie środków nadzwyczajnych (np. stwierdzenie nieważności decyzji – art. 248 § 2 pkt 1 o.p.),
  • rozpatrywanie ponagleń (art. 141 o.p.).

W strukturze KAS organem wyższego stopnia jest najczęściej dyrektor izby administracji skarbowej w stosunku do naczelników urzędów skarbowych i celno-skarbowych (art. 25 ust. 3 u.KAS).
Natomiast w samorządach organem wyższego stopnia w stosunku do wójta, burmistrza, prezydenta, starosty i marszałka województwa jest samorządowe kolegium odwoławcze.

⚠️ Ważne: Między organami samorządowymi a SKO nie występuje hierarchiczna podległość służbowa – to odrębne jednostki, powiązane jedynie przez funkcję odwoławczą.


Tabela – klasyfikacja organów podatkowych (opracowanie uproszczone)

KryteriumOrgany administracji rządowejOrgany samorządowe
Pierwsza instancjaNaczelnicy urzędów skarbowych, naczelnicy urzędów celno-skarbowych, dyrektorzy izb administracji skarbowej, dyrektor KIS, Szef KAS, minister finansówWójtowie, burmistrzowie, prezydenci miast, starostowie, marszałkowie województw
Druga instancjaDyrektorzy izb administracji skarbowej, Szef KAS, dyrektor KIS, minister finansówSamorządowe kolegia odwoławcze
Zasięg działaniaCentralny: minister finansów, Szef KAS, dyrektor KIS; Terenowy: DIAS, urzędy skarbowe i celno-skarboweTerenowy: organy JST i SKO
Skład osobowyMonokratycznyMonokratyczny lub kolegialny (SKO)

📚 W praktyce dla przedsiębiorcy kluczowe znaczenie ma świadomość, do którego organu należy kierować odwołanielub wniosek, oraz jaki jest jego charakter – rządowy czy samorządowy. To determinuje zarówno właściwość miejscową, jak i tryb postępowania.


Podstawa prawna

W poradniku przywołano następujące przepisy:

  • art. 13 § 1–3 – Ordynacja podatkowa (Dz.U. z 2024 r. poz. 2383) – określa katalog organów podatkowych, ich funkcje instancyjne oraz pojęcie organu wyższego stopnia.
  • art. 2 – ustawa o Krajowej Administracji Skarbowej (Dz.U. z 2023 r. poz. 180) – wskazuje zakres zadań KAS, w tym realizację dochodów budżetu państwa, egzekucję należności publicznoprawnych, przeciwdziałanie praniu pieniędzy i finansowaniu terroryzmu.
  • art. 25 ust. 1 i 3 – ustawa o Krajowej Administracji Skarbowej – określa, że dyrektor izby administracji skarbowej sprawuje nadzór nad naczelnikami urzędów skarbowych i celno-skarbowych oraz stanowi organ wyższego stopnia w stosunku do nich.
  • art. 36 ust. 1 – ustawa o Krajowej Administracji Skarbowej – wymienia jednostki organizacyjne KAS: urząd obsługujący ministra finansów, KIS, izby administracji skarbowej, urzędy skarbowe, urzędy celno-skarbowe i Krajową Szkołę Skarbowości.
  • art. 248 § 2 pkt 1 – Ordynacja podatkowa – reguluje właściwość organów wyższego stopnia w zakresie stwierdzania nieważności decyzji podatkowych.
  • art. 141 – Ordynacja podatkowa – dotyczy ponagleń w przypadku niezałatwienia sprawy w terminie.
  • art. 5 § 2 – Kodeks postępowania administracyjnego (Dz.U. z 2024 r. poz. 1054) – zawiera katalog organów administracji publicznej, do których zalicza samorządowe kolegia odwoławcze.

Tematy zawarte w poradniku

  • struktura i zadania Krajowej Administracji Skarbowej (KAS),
  • kompetencje i hierarchia organów podatkowych,
  • samorządowe organy podatkowe i ich właściwość,
  • rola samorządowych kolegiów odwoławczych (SKO) w postępowaniu podatkowym,
  • podział organów podatkowych według instancji, zasięgu i składu osobowego.

Linki do źródeł

Czy ta porada była dla Ciebie pomocna?

Zobacz również: